LAMMPS

LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)

Para execução do LAMMPS é possível utilizar a versão lammps_10Feb15 que se encontra na pasta /work1/local/lammps_10Feb15.

Para submissão no Loadleveler, pode-se utilizar o exemplo abaixo:

### Indicar o diretorio para inicio da execucao ###
# @ initialdir = /home/user/workxx/

### Indicar o nome do job ###
# @ job_name = teste

### Nome do arquivo de saida ###
# @ output = saida

### Nome do arquivo de erros ###
# @ error = erros

### email do usuario ###
# @ notify_user = xx@ft.unicamp.br

### Enviar todas e quaisquer notificacoes ###
# @ notification = complete

### Especificar a fila de execucao ###
# @ class = paralela

### Especificar o tipo de job: parallel ou serial ###
# @ job_type = parallel

### Informar numero de nodes de processamento ###
# @ node = 1

### Informar numero total de processos ###
# @ total_tasks = 8

### Informar se possui checkpoint ###
# @ checkpoint = no
# @ queue
export MP_SHARED_MEMORY=yes
export MEMORY_AFFINITY=MCM
poe /work1/local/lammps_10Feb15/lmp_power -procs 8 < /home/user/workxx/in.chain

Mais informações do software http://lammps.sandia.gov/doc/Manual.html